上海醫科大學前身是上海醫學院,民國16年(1927年)7月在上海吳淞創建時,名為國立第四中山大學醫學院,是中國國立大學創辦的第一所醫學院,由顏福慶出任首任院長,政府撥給吳淞鎮前國立政治大學舊址為校捨。1928年2月,第四中山大學更名為國立江蘇大學,1928年5月,再更名為國立中央大學,醫學院又先後更名為江蘇大學醫學院、中央大學醫學院。民國21年(1932年)校捨被日軍炮火所毀;同年9月,國立中央大學醫學院獨立為國立上海醫學院,為中國唯一的國立醫學院。民國25年(1936年)創辦藥學專修科。同年,醫學院遷入楓林橋新址(今醫學院路138號)。
民國25年(1936年)起,建造上海醫事事業中心,相繼建造大小建築15幢,建築面積為19.7萬平方英尺。這些建築由基泰工程司承辦,隆昌建築公司設計。主要有第一教學樓、工學樓、松德堂、職工宿捨等,在當時可稱規模宏大。其中以第一教學樓規模最雄偉,這是一座鋼筋混凝土結構的中西混合式建築。中央高四層,下三層為鋼筋混凝土結構,第四層為木架梁,兩翼高三層,建築面積9.395萬平方英尺。建築平面為『凹』字形,左右對稱布局,中間底樓有三券門,進入大門為大禮堂,高度貫至二、三層,兩翼呈曲尺形,室內裝飾亦為民族形式。底層前設平臺,平臺上方有漢白玉欄杆。中部為黃色琉璃瓦廡殿式屋頂,左右兩側樓為平頂,兩側翼頂端各有一四角攢尖方亭,與主體之間以廊道連接。建築立面為機制紅磚清水牆,細部用民族形式的花紋裝飾。檐下架上施傳統彩畫圖案,屋脊之上吻獸,門前左右兩尊石獅等頗顯中國清代官式建築特色。樓前則是西方園林風格巴洛克式的庭院綠化和噴水池。
1937年,抗戰爆發,醫學院內遷至雲南昆明白龍潭;1940年輾轉遷至四川重慶歌樂山,由朱恆壁任校長。1946年,抗戰勝利,遷回上海。1952年,更名為『上海第一醫學院』,顏福慶任院長。1959年被定為全國16所重點高等學府之一。1985年,更名為『上海醫科大學』。1994年,通過211工程(中國21世紀重點建設100所大學計劃)預審,為上海第一所獲此資格的高校。2000年4月,上海醫科大學和復旦大學合並辦學,組建為新的復旦大學。兩校合並後,為進一步豐富上醫校史館館藏,更好地展現上醫乃至中國近現代醫學教育的歷史,復旦大學組織力量開展了上海醫科大學校史館復館工作,校史館選址就在第一教學樓。
上海醫科大學校史館展出了許多珍貴的歷史照片和書籍資料,包括重要歷史事件、重要人物及其背後的經典故事等。從1927年到2000年,從創校的艱辛到抗戰時期的動蕩,從投身抗美援朝到參與國家公共衛生體系建設,各個階段的歷史都得到了充分的展現。
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