上海金山三島海洋生態自然保護區（簡稱金山三島）是上海市所轄范圍內第一個自然保護區，成立於1993年6月5日。該保護區位於杭州灣北岸，坐落在上海市金山縣，距金山嘴海岸約3.56海裡，由核心區（大金山島）和緩沖區（小金山島、浮山島以及鄰近0.62英裡范圍內的海域）組成。保護區內自然環境優良、生物種類繁多、自然植被保存良好，是上海地區野生植物資源最豐富的地方，也是環境質量最為清潔的區域，因此可作為上海市重要的環境質量對照點，具有較高的保護價值。該區主要保護對象為典型的中亞熱帶自然植被類型樹種，常綠、落葉闊葉混交林，昆蟲及土壤有機物，野生珍稀植物樹種，近江牡蠣等。

　　大金山島位於杭州灣口北部，距大陸金山嘴3.35海裡。該島平面形態略呈菱形，中部寬闊，西部狹窄，最長處0.6英裡，最寬處0.27英裡，海岸線長度1.48英裡，面積31.2萬平方英尺，主峰高339.3英尺，是上海市最高和最大的基岩島。該島與小金山島和浮山島都曾是陸上的弧丘，後因海面上昇、海岸侵蝕後退而孤立於大海中。五代以前稱『釗山』，晉代以後稱『金山』。大金山島岩性以酸性石英斑岩，夾雜有流紋岩、火山角礫岩、英安岩等。該島受波浪侵蝕，形成海蝕崖、海蝕平臺和海蝕柱等地貌形態。在島的西南部有一片長0.466英裡、寬164∼197英尺的礫石灘。島上有兩處水井，面積108∼215平方英尺，深度14.77英尺。此外，在山腹坑道內有兩處泉水，水中硫和鐵的含量較高，水呈酸性。大小金山島間，歷史上稱為『金山門』，門內即為金山門海峽。金山門海峽深槽長約13.5海裡，最寬處在1.62海裡左右，最大水深可達164英尺左右。大金山島周圍海域底質以泥質粉砂為主，局部地區有粉砂和細砂分布，沖刷嚴重的地方有老的海相粘土初露。

　　大金山島土壤類型為褐色山地黃壤。島上植被屬中亞熱帶地帶性植被，受人類影響較小，仍保持著原始植被狀態。島上植被茂盛，落葉闊葉林有日本野桐、黃檀、算盤子群落；常綠闊葉林有紅楠群落和青岡礫群落。此外，還有竹林，類型有篌竹群落等。島上還有灌木、草本植物和蕨類植物分布。由於該島遠離大陸，遭受人類影響較小，基本上仍保持著原始狀態，是『金山三島海洋生態自然保護區』中最大的島嶼。大金山島過去曾有過部隊駐防，現無定居者，但因島上養殖獼猴而時有飼養員臨時性居住。

　　小金山島位於杭州灣口北部，距大陸金山嘴2.2海裡。該島地勢平坦，呈西北-東南走向，最長處0.28英裡，最寬處0.15英裡，主峰高106.6英尺，海岸線長度0.63英裡，面積38.8萬平方英尺，是『金山三島海洋生態自然保護區』的一部分。

　　浮山島位於杭州灣口北部，大金山島南0.34海裡的海面上。海島外廓呈橢圓狀，山體渾圓無峰，整個山體形態似烏龜，俗稱『烏龜山』，古代亦稱『王盤山』。浮山島全長約0.18英裡，最寬處0.11英裡，面積33.4萬平方英尺，海岸線長度0.78英裡，主峰高101英尺。浮山島是由中酸性火山岩和紅色碎屑岩組成的基岩島，主要岩石有石英斑岩、火山角礫岩和英安岩等。由於山體受海浪和大風侵蝕，風化強烈，岩石裸露，島上無喬木和灌木，僅在岩縫中生長刺槐雜草，還有少量蕨類、苔蘚、地衣等低等植物，該島也是『金山三島海洋生態自然保護區』的一部分。島上無水源，也無人定居。